Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CdaP56389 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CdaP56389 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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