Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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CartptP56388 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CartptP56388 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CartptP56388 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CartptP56388 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CartptP56388 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CartptP56388 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CartptP56388 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CartptP56388 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CartptP56388 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CartptP56388 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CartptP56388 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CartptP56388 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CartptP56388 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CartptP56388 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms