Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms