Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GemP55041 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GemP55041 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GemP55041 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GemP55041 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GemP55041 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GemP55041 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GemP55041 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GemP55041 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms