Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HccsP53702 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HccsP53702 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HccsP53702 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HccsP53702 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms