Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux1P53564 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux1P53564 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms