Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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