Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Efnb1P52795 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Efnb1P52795 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efnb1P52795 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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