Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms