Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms