Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdhaP50136 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms