Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms