Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3P48787 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms