Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms