Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms