Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms