Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr7P47774 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms