Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax9P47242 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax9P47242 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms