Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms