Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms