Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syt4P40749 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syt4P40749 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syt4P40749 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syt4P40749 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms