Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TfamP40630 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TfamP40630 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms