Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms