Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms