Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfc1P35601 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms