Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetP35546 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RetP35546 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RetP35546 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RetP35546 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetP35546 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms