Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpardP35396 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpardP35396 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpardP35396 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PpardP35396 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms