Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms