Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2aP34056 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms