Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrm4P32211 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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