Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms