Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms