Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms