Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Marcksl1P28667 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Marcksl1P28667 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms