Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BgnP28653 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BgnP28653 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BgnP28653 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BgnP28653 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BgnP28653 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BgnP28653 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BgnP28653 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BgnP28653 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BgnP28653 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BgnP28653 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BgnP28653 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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