Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd9P28357 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms