Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms