Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LoxP28301 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LoxP28301 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LoxP28301 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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