Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms