Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms