Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpbP28033 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpbP28033 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms