Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U2af2P26369 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms