Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChgaP26339 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms