Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmo2P25801 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo2P25801 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo2P25801 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo2P25801 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo2P25801 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo2P25801 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms