Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd1P25322 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms