Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms