Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd8P23463 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms