Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms