Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms