Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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